Организационная структура внутренней системы оценки качества образования в Уральской государственной консерватории имени М.П. Мусоргского включает несколько уровней, обеспечивающих распределение полномочий и ответственности между всеми участниками образовательного процесса.
Первый уровень представлен Учёным советом Консерватории и ректоратом. Учёный совет определяет стратегические направления развития ВСОКО, утверждает локальные нормативные акты, регламентирующие оценочные процедуры, и рассматривает итоговые аналитические отчёты. Ректорат обеспечивает организационное руководство и принимает управленческие решения по результатам оценки качества.
Второй уровень образуют проректоры по направлениям деятельности и учебный отдел. Проректор по учебной работе координирует текущий контроль успеваемости и промежуточную аттестацию, организует мониторинг качества учебного процесса. Проректор по научной работе курирует оценку научно-исследовательской и творческой составляющих подготовки обучающихся. Учебный отдел осуществляет сбор, обработку и систематизацию данных о результатах аттестаций, формирует статистическую и аналитическую отчётность.
Третий уровень включает деканаты, кафедры и педагогических работников. Деканаты отвечают за организацию и проведение оценочных процедур на факультетах, ведение зачётных книжек и ведомостей. Кафедры разрабатывают фонды оценочных средств, проводят текущий контроль и промежуточную аттестацию по дисциплинам и практикам, анализируют качество подготовки обучающихся по профильным направлениям.
Четвёртый уровень представлен обучающимися и их представительными органами. Студенческий совет участвует в независимой оценке качества образования через анкетирование, опросы удовлетворённости условиями обучения и обсуждение результатов на заседаниях коллегиальных органов Консерватории. Мнение обучающихся учитывается при корректировке образовательных программ и совершенствовании учебного процесса.